| ANO | Campeão masculino | Campeão feminino |
| 1998 | Guilherme Bier | Fabiana Carreço |
| 1999 | Guilherme Bier | Fabiana Carreço |
| 2000 | Guilherme Bier | Viviane Motti |
| 2001 | Fábio Lima | Viviane Motti |
| 2002 | Carlos Pavão | Viviane Motti |
| 2003 | Carlos Pavão | Natália Yakovleva |
| 2004 | Guilherme Bier | Bruna Cavalcante |
| 2005 | Guilherme Bier | Maria da Penha Cruz |
| 2006 | Luiz Lima | Ana Marcela Cunha |
| 2007 | Allan do Carmo | Ana Marcela Cunha |
| 2008 | Luiz Lima | Maria da Penha Cruz |
| 2009 | Allan do Carmo | Ana Marcela Cunha |
| 2010 | Matheus Evangelista * | Ana Marcela Cunha |
| 2011 | Allan do Carmo | Ana Marcela Cunha |
| 2012 | Samuel de Bona | Ana Marcela Cunha |
| 2013 | Samuel de Bona | Ana Marcela Cunha |
| 2014 | Allan do Carmo | Ana Marcela Cunha |
* Samuel de Bona foi o vencedor em pontos na temporada, ao testar positivo para doping na última prova foi desclassificado.
Em 2010 o Campeão Brasileiro foi Matheus Evangelista, do Grêmio Náutico União de Porto Alegre. Inclusive foi o mais jovem nadador a sagrar-se Campeão Brasileiro de Águas Abertas.